Opis novih bakterijskih vrst, letno je objavljenih 400 do 600 vrst, je zelo zahtevno opravilo za katerega ni ravno usposobljenih veliko laboratorijev, opozarjajo poznavalci. Za dokaz kako različni so bakterijski izolati uporabljajo mikrobiologi analizo 16S ribosomske ribonukleinske kisline (rRNK). Dodatno je mogoče povečati zanesljivost presoje, kako (ne)sorodni sta si dve bakteriji, z metodo DNK-DNK hibridizacije, ki pa je precej zahtevnejša. V splošnem je doslej veljalo, da skladnost v zaporedju 16S rRNK v 97,5% s precejšnjo gotovostjo določa novo bakterijsko vrsto. Vendarle pa prof. Erko Stackebrandt iz nemške Zbirke mikroorganizmov in celičnih kultur iz Braunschweiga svetuje, da je mogoče pri klasifikaciji novih vrst z dvigom praga skladnosti na 98,7% opustiti skoraj dve tretjini dolgotrajnejših DNK-DNK hibridizacij. In če še naprej dvignemo prag skladnosti na 99% potem se celo lahko izognemo devetim od desetih hibridizacij brez izgube znanstvene točnosti.
Naročite se na:
Objavi komentarje (Atom)
Ni komentarjev:
Objavite komentar